home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00277 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  26 lines
  1. ********************************
  2. * Caseins alpha/beta signature *
  3. ********************************
  4.  
  5. Caseins [1]  are the  major  protein  constituent  of  milk.  Caseins  can  be
  6. classified into two families; the first consists of the kappa-caseins, and the
  7. second groups the alpha-s1, alpha-s2, and beta-caseins. The alpha/beta caseins
  8. are a rapidly diverging family of proteins. However two regions are conserved:
  9. a cluster of  phosphorylated  serine residues  and  the signal  sequence.  The
  10. signature pattern we selected for this family of proteins is based on the last
  11. eight residues of the signal sequence.
  12.  
  13. -Consensus pattern: C-L-[LV]-A-x-A-[LVF]-A
  14. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  15. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: mammalian 47 Kd heat shock protein;
  16.  in these proteins the pattern also corresponds to the signal peptide.
  17.  
  18. -Note: alpha-s2 casein is  known as epsilon-casein in mouse,   gamma-casein in
  19.  rat and  casein-A in guinea pig.  Alpha-s1 casein is known as alpha-casein in
  20.  rat and rabbit and as casein-B in guinea-pig.
  21.  
  22. -Last update: December 1992 / Text revised.
  23.  
  24. [ 1] Holt C., Sawyer L.
  25.      Protein Eng. 2:251-259(1988).
  26.